Tuesday 5 October 2010

Premier recensement mondial de vie marine révèle que, où, comment beaucoup de vies et masqués dans les océans de la planète, milliard marine différents microbes

Type = "html" > après une décennie de travail conjoint et d'aventure scientifique, des explorateurs marins depuis plus de 80 pays, y compris les six scientifiques dans le Laboratoire biologique marine (MBL), aujourd'hui (4 octobre) livré la première mondiale recensement de la marine vie révéler ce qui, où, comment beaucoup vit et masque dans les océans du monde. Dans l'un des collaborations scientifiques plus grandes jamais réalisées, plus de 2 700 scientifiques a passé plus de 9 000 jours en mer sur plus de 540 expéditions collecte les données.

À la suite de ces efforts scientifiques a découvert qu'il peut y avoir jusqu'à 1 milliard de types de microbes marines : plus de 100 fois plus variées que les plantes et les animaux — et comme 38 000 types de microbes dans un litre typique de l'eau de mer.


Les acantharians sont un des quatre types d'amibes importants qui se produisent dans les eaux marines ouverts. Leurs squelettes fragiles sont faites d'un cristal unique de sulfate de strontium qui rapidement se dissout dans l'eau de mer après que la cellule meurt.
Crédit : Linda Amaral Zettler (micro * portée)


Une équipe de chercheurs de Bay Paul Center de le MBL et leurs collègues dans 25 pays était parmi les scientifiques contribuant le recensement par leur leadership de l'international recensement de Marine Microbes (ICoMM), un projet de recherche de la plus grande Du recensement de la vie marine, axée sur la biodiversité des formes de vie microscopiques dans les océans du monde.

Sur les six dernières années, ICoMM a amassé plus de 25 millions de séquences génétiques de microbes qui nage dans 1 200 sites autour de la terre — de baies polaires de mers tropicales ; des estuaires offshore ; sur les coraux, éponges et baleine carcasses ; des eaux de surface pour les fumeurs en eau profonde.

La plupart de la biodiversité de la planète est microbienne dans la nature, en particulier dans les océans. Pour plus de trois milliards d'années, ces créatures ont médiatisée processus critiques qui façonnent habitability la planète.

En 2006, les scientifiques ICoMM fait la découverte étonnante que tandis que quelques espèces microbiennes dominent les océans, la plupart des est très faible en abondance.Mitchell Sogin, directeur de la MBL Centre de Paul Bay et leader du projet ICoMM appelé ce domaine nouveau et inexploré de vie microbienne «la biosphère rare.»

Peu après cette découverte, Sogin a commencé grâce à un puissant type du séquenceur d'ADN qui a permis l'analyse de la diversité microbienne dans des échantillons de plus nombreux, beaucoup plus rapidement.Sa nouvelle méthode, appelée "Pyro-marquage," a attiré un financement supplémentaire pour développer le recensement. Un appel aux scientifiques a obtenu une réponse enthousiaste et de haute qualité, et 40 laboratoires nouvelles ont été choisis pour envoyer des échantillons microbiens marins à la MBL de séquençage.

«Dès le début, lorsque nous avons décider comment nous pourrions faire un sondage auprès des microbes marines, il a été un effort de la Communauté,» dit Sogin."Prélèvement est un jeu très coûteux, surtout en termes d'exécution des navires, mais les laboratoires présentant payé pour que, qui dégagé un obstacle financier pour le recensement". Entre-temps, à la MBL, "nous avons réalisé immédiatement que nous avions besoin de capacités de bioinformatique qui n'existaient pas" pour gérer les données, dit Sogin. Ils conçus de bases de données qui permettent la visualisation de la diversité microbienne de plusieurs façons graphiques et qui combinent les données génétiques des informations sur habitats des microbes.

Au début, les scientifiques ICoMM également fait la décision cruciale pour recueillir des données pas seulement génétiques sur les microbes (ce qui seraient séparez-les par type), mais des informations contextuelles également sur où ils ont été trouvés : latitude et longitude, profondeur de l'océan, pH de l'eau, salinité et autres conditions.Ce qu'ils ont trouvé que tous les microbes ne sont pas partout.Malgré une capacité à disperser largement dans les océans, les scientifiques a découvert que les communautés microbiennes caractéristiques peuvent définir des masses d'eau différents dans l'océan et peuvent nous apprendre sur la santé des écosystèmes différents.

«Croyez-le ou non, c'est unique, ce couplage de données de la diversité (génétique) et contextuelle,» affirme Linda Amaral Zettler, MBL adjoint scientifique et responsable du programme ICoMM.«Le gros avantage est qu'il permet les chercheurs à poser des questions écologiques sur les populations microbiennes qui ne pourraient autrement pas être posées.»

Maintenant est le plus excitant de temps, lorsque "choses commencent à se dérouler, et histoires sont dit," dit Amaral Zettler.«Nous croyons que nos analyses nous dira histoires très intéressants.»

Le recensement de la vie marine a été lancée en 2000 par Alfred P. Sloan Foundation.Au cours de la décennie le recensement a augmenté à une exploration globale de 650 millions de dollars, impliquant plus de 670 institutions et de plus de 10 fois les 250 collaborateurs originales.Le recensement se composait de 17 projets qui touchent les habitats importants groupes d'espèces dans l'océan mondial.

Plus de 300 dirigeants de la Communauté de recensement réuni le 4 octobre à 7 à Londres à la Royal Institution of Great Britain, la Royal Society et Musée d'histoire naturelle à partager leurs dix années de résultats et d'examiner leurs implications.

Une suite pour le recensement est explorée au cours des réunions de Londres et à la Conférence mondiale sur la biodiversité marine en septembre prochain à Aberdeen, en Écosse.

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Le MBL est une institution internationale, indépendante, sans but lucratif leader dédiée à la découverte et à l'amélioration de la condition humaine via créative de recherche et d'enseignement dans le domaine des sciences biologiques, biomédicaux et environnementaux.Fondée en 1888, le Laboratoire biologique marine, le MBL est le plus ancien laboratoire marin privé dans les Amériques.


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